Parafia Wójtowo liczy sobie już 2 lata. Od tego czasu prowadzi ją ksiądz proboszcz Krzysztof Bumbul, który przybył do nas z Lidzbarka Warmińskiego. Początkowo nabożeństwa odbywały się w budynku po szkole podstawowej. W czerwcu 2000 roku został uroczyście poświęcony krzyż parafii Wójtowo.
Kilka miesięcy później dzięki pomocy firmy Madrew oraz ofiarnej pracy mieszkańców stanęła kaplica, w której obecnie odbywają się nabożeństwa oraz zebrania wiejskie.
Obecnie nieopodal kaplicy budowany jest kościół parafii wójtowskiej.